Il Pisco ha le sue origini nel XVI secolo durante l'era coloniale nel Vicereame del Perù. Il nome deriva dal porto peruviano di Pisco, dove si utilizzavano vasi di terracotta chiamati 'piskos' per conservare l'acquavite.
La produzione iniziò quando i colonizzatori spagnoli portarono le uve vitis vinifera in Sudamerica. Sia il Perù che il Cile mantengono rivendicazioni storiche sul Pisco, ognuno con la propria Denominazione d'Origine e metodi di produzione distinti.
Il Pisco peruviano tradizionale utilizza otto varietà d'uva, tra cui Quebranta, Italia e Moscatel, mentre il Pisco cileno utilizza principalmente varietà di Moscato.